Informe 2011 del Dr. Rafael Palacios, Coordinador de la LCG: "Estado actual de la LCG"

La LCG se concibió en 2001 y se creó en 2003 con objeto de formar líderes académicos para el desarrollo futuro de las ciencias genómicas en México.

A. LA LCG ES UN PROYECTO EXITOSO

1. RESULTADOS CUANTITATIVOS GLOBALES

La primera Generación de la LCG inició sus estudios en Agosto de 2003; la novena generación ingresó en Agosto de 2011. Las generaciones 1-5 se graduaron y las generaciones 6-9 continúan en la LCG. El total de estudiantes inscritos contando las 9 generaciones es de 251. La Fig. 1 indica la situación actual de cada estudiante. Como puede apreciarse, hemos tenido la desgracia de tres fallecimientos. Ha habido 18 deserciones, las cuales han ocurrido por lo general en los primeros semestres de la carrera. En la actualidad existe únicamente un alumno irregular. Con excepción de este caso, todos los estudiantes de las 5 primeras generaciones se han graduado, lo que significa que han concluido sus estudios exitosamente. De un total de 147 estudiantes graduados se han titulado 115 (80%). Se espera que el resto de los estudiantes graduados se titulen en un futuro próximo. Solo tenemos evidencia de dos estudiantes que se encuentran desarrollando actividades ajenas a las ciencias genómicas y que han expresado extraoficialmente que no tienen la intención de titularse.

Fig. 1

El Plan de Estudios de la LCG incluye la realización de trabajo de investigación o profesional durante el cuarto año. En general las primeras generaciones realizaron esta actividad en alguna de las dos sedes del programa, el Centro de Ciencias Genómicas y el Instituto de Biotecnología. Sin embargo, esta situación ha cambiado conforme avanzan las generaciones. La realización del trabajo de investigación se ha diversificado tanto a nivel nacional como internacional. En el nivel nacional han participado como receptoras de estudiantes otras entidades académicas de la UNAM, tales como los Institutos de Investigaciones Biomédicas, Fisiología Celular y Ecología, así como otras instituciones incluyendo el Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad (LANGEBIO), el Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), el Instituto Nacional de Salud Pública y el Instituto Nacional de Ciencias Médicas y de la Nutrición Salvador Zubirán, entre otras. Por otra parte, la realización del trabajo de investigación en el extranjero se ha incrementado para llegar a ser del 70 % en los estudiantes de la sexta generación (Fig. 2A). La LCG no cuenta con presupuesto para apoyar a los estudiantes durante su trabajo de investigación. El que los estudiantes puedan realizarlo en distintas instituciones esta relacionado con el prestigio que ha adquirido la LCG tanto a nivel nacional como internacional. Este prestigio se basa en la originalidad de su Plan de estudios y en la calidad de sus estudiantes.

De los estudiantes que han cursado la LCG, 99 se encuentran realizando programas de posgrado, la gran mayoría pertenecientes a las 4 primeras generaciones. Aproximadamente la mitad realiza sus estudios de posgrado en México, y la otra mitad en el extranjero (Fig. 2B). Los posgrados de México que cuentan con el mayor número de estudiantes son la Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas y el Doctorado en Ciencias Biomédicas. Varios estudiantes de la quinta generación, que se graduó en Junio de este año, se encuentran ya inscritos en Programas de posgrado e iniciarán sus estudios en Agosto o Septiembre de 2011.

Fig. 2

Entre las instituciones del extranjero que han recibido a estudiantes de la LCG para realizar su estancia de investigación o para realizar sus estudios de posgrado se encuentran algunas de gran prestigio internacional. De hecho, las instituciones que han recibido mayor número de estudiantes (3 o más) son: University of California, Harvard University, Cold Spring Harbor Laboratory, en Estados Unidos; Sanger Institute en Inglaterra; Institute Pasteur en Francia; Max Plank Institute en Alemania; y University of Copenhagen en Dinamarca.

El análisis de estos datos indica claramente que la LCG tiene un nivel académico muy alto, con poca deserción y un elevado índice de titulación. Es particularmente importante destacar que la mayor parte de los estudiantes que terminan la licenciatura continúan su preparación con estudios de posgrado.

2. RESULTADOS CUALITATIVOS

El Programa Internacional “Frontiers in Genomics” y el Programa Nacional “Aplicaciones de la Genómica” han permitido que los estudiantes interaccionen en forma directa y profunda con académicos líderes en diferentes aspectos de las ciencias genómicas, provenientes tanto de instituciones nacionales como del extranjero. El coordinador actual de la LCG se ha entrevistado con aproximadamente 120 líderes internacionales del área. La opinión de estos líderes es prácticamente unánime. La LCG es un Programa único que está preparando a estudiantes de un nivel comparable a los de las mas prestigiadas instituciones del mundo. En la página web de la LCG (ver sección sobre evaluación internacional) se publica el texto íntegro de cartas enviadas por distintos profesores invitados a los que se pidió su opinión formal escrita como parte de la evaluación de la LCG

B. EL PLAN DE ESTUDIOS DE LA LCG REPRESENTA UN NUEVO PARADIGMA EN LA ENSEÑANZA DE LAS CIENCIAS GENOMICAS.

Es importante destacar que hace casi 40 años surgió en la UNAM un nuevo paradigma para la formación de investigadores: la Licenciatura en Investigación Biomédica Básica. Este proyecto, ideado y lidereado por el Dr. Jaime Mora fue creado en la UNAM siendo Rector el Dr. Guillermo Soberón. En esta licenciatura los estudiantes se encontrarían inmersos en la realización de investigación original y adquirirían conocimiento con base en las necesidades generadas por su propia investigación. Este Programa, continuado por una Maestría y un Doctorado ha formado un gran número de investigadores, entre los cuales se encuentran muchos de los líderes actuales de la investigación biomédica en México. El Programa de Investigación Biomédica Básica representa un antecedente histórico fundamental que inspiró la creación de la Licenciatura en Ciencias Genómicas.

1. INTEGRACIÓN DE DISCIPLINAS.

El Plan de Estudios de la LCG conjunta conocimiento derivado de las tres disciplinas que constituyen el soporte científico de las Ciencias Genómicas: las Matemáticas, las Ciencias Computacionales y la Biología Moderna en sus diferentes áreas. Estas disciplinas se enseñan durante el nivel básico como asignaturas independientes. Durante el segundo año estas disciplinas se conjuntan para formar las ramas principales de la Genómica: la Bioinformática, la Genómica Funcional y la Genómica Evolutiva, y para revisar los principales modelos genómicos, con especial énfasis en el Genoma Humano. Un nivel mayor de integración se logra en el tercer año con las disciplinas de Bioética y Biología de Sistemas, así como por medio de los seminarios y discusiones de proyectos de investigación con líderes del área tanto a nivel nacional (Aplicaciones de la Genómica) como a nivel internacional (Fronteras de la Genómica)

2. NIVELES DE MADURACIÓN.

El Plan de estudios y el sistema de enseñanza-aprendizaje de la LCG esta estructurado en cuatro niveles de integración, cada uno de los cuales representa un cambio cuántico en el nivel de maduración del estudiante.

Durante el primer nivel o Nivel Básico (año 1) el estudiante debe adquirir una importante cantidad de conocimiento en las disciplinas básicas. Las actividades consisten fundamentalmente en la discusión de conceptos básicos con los profesores respectivos, teniendo como material de estudio libros de texto y artículos científicos clásicos.

Durante el segundo nivel o Nivel Avanzado (año 2) el estudiante enfrenta las áreas fundamentales de las Ciencias Genómicas y los principales Modelos de estudio que utiliza la genómica. El sistema de enseñanza-aprendizaje se basa en la discusión de literatura científica reciente y en la realización de proyectos de entrenamiento.

En el tercer nivel o Nivel Integrativo (año 3) ya no existen cursos estructurados. El sistema de enseñanza aprendizaje se basa en discusiones de proyectos de investigación con los investigadores responsables de los proyectos. Durante este año los estudiantes revisan aproximadamente 50 proyectos de investigación, centrados en muy diversos tópicos relacionados con las ciencias genómicas.

El cuarto año esta dedicado a la realización de un proyecto de investigación dentro de un grupo reconocido por su liderazgo en alguna rama de las ciencias genómicas.

Es en esta forma que la LCG lleva al estudiante por niveles sucesivos de maduración que abarcan la adquisición de conocimiento, la discusión de literatura reciente, la discusión de proyectos de investigación con los investigadores responsables y finalmente, la realización de investigación original como parte de un equipo académico de primer nivel.

3. COMPLEMENTO CON TALLERES Y WORKSHOPS OPTATIVOS.

El Plan de Estudios de la LCG se complementa con actividades académicas de interés para estudiantes específicos. En un principio estas actividades eran sugeridas al Coordinador y se presentaban para aprobación del Comité Académico. Una vez aprobadas se acordaba la forma de evaluación que en general consistía en considerarlas como asignaturas optativas y como tales se calificaban.

Con la experiencia adquirida en relación a estas actividades, en la actualidad se ha optado por otro sistema que ha resultado mas atractivo y estimulante para los estudiantes. Los propios estudiantes diseñan la actividad académica desde su concepción, contactan a los investigadores nacionales o extranjeros que deban participar y acuden al Coordinador de la LCG para solicitar el apoyo necesario para la implementación de la actividad. En esta forma la actividad académica depende totalmente del interés y compromiso de los estudiantes. Estas actividades no se califican y como estímulo por su participación exitosa los estudiantes y profesores reciben constancias oficiales que los estudiantes pueden incluir en sus curricula vitarum. La participación en este tipo de actividades es en general tomada en cuenta por los Comités de Admisión a Estudios de Posgrado.

Entre los Talleres y Workshops que se han llevado a cabo en la LCG se encuentran los siguientes tópicos:

• PROGRAMACIÓN EN R Y APLICACIÓN DE BIOCONDUCTOR
• GENÓMICA FORENSE
• BIOLOGÍA SINTÉTICA (IGEM)
• BIOLOGÍA DE SISTEMAS
• MEDICINA GENÓMICA
• PROCESOS ESTOCÁSTICOS
• MATEMÁTICAS AVANZADAS
• EPIGENÉTICA
• METAGENÓMICA
• DNA ANTIGUO

Es importante destacar que algunos de estas actividades se han convertido en asignaturas que se ofrecen formalmente dentro del Plan de Estudios, tales como Programación en R y Aplicación de Bioconductor, Biología de Sistemas, Estadística Matemática, y Procesos Estocásticos; y que otros han derivado en actividades contínuas en la LCG, tales como la Genómica Forense y la Biología Sintética (iGEM). Mas aún, algunas de estas actividades han quedado en manos de los estudiantes, debido a que no contamos con investigadores expertos en los temas correspondientes. Este es el caso de Programación en R y Aplicación de Bioconductor, Genómica Forense y Biología Sintética (iGEM).

En el caso de la Biología Sintética los estudiantes han formado el Equipo LCG-UNAM que ha participado en el concurso internacional organizado por el MIT durante los últimos 3 años. Este equipo esta formado por estudiantes de una generación que posteriormente entrenan a los de una generación posterior para formar el nuevo equipo. La actuación de estos equipos de la LCG ha sido realmente extraordinaria. En 2008 el equipo correspondiente obtuvo una Medalla de Bronce, en 2009 una Medalla de Plata y en 2010 una Medalla de Oro. Los datos relacionados con los proyectos presentados por los estudiantes y los resultados en el concurso iGEM pueden localizarse en la sección de Noticias de la Página Web de la LCG.

4. SISTEMA DINÁMICO DE EVALUACIÓN

El sistema de evaluación en la LCG va cambiando en relación a la maduración de los estudiantes, lo cual se correlacionan con el nivel del Plan de estudios en el que se encuentran. En el Nivel básico la evaluación se realiza fundamentalmente con base en exámenes de conocimientos. En el Nivel avanzado lo mas importante es la participación de los estudiantes en las sesiones de clases y en proyectos de entrenamiento. Las actividades del Nivel Integrativo se evalúan por la calidad de las ideas, planteamientos y proposiciones expresadas por los estudiantes ante el investigador responsable del proyecto que se discute en el seminario correspondiente. Finalmente, la evaluación de todas las asignaturas del Nivel de Investigación se consolida en el desempeño del estudiante como parte de un equipo de investigación.

5. OPINIONES CUALITATIVAS SOBRE EL PROGRAMA DE LA LCG.

Como se mencionó anteriormente, el Coordinador se ha entrevistado con todos los investigadores que han participado en los ciclos de Fronteras de la Genómica. La opinión general es que el Programa de la LCG es único en su estructura y que sería deseable para algunas instituciones académicas de gran prestigio internacional el tomar algunas de las características que identifican al de la LCG para incorporarlas a sus programas de pregrado. Algunas de estas opiniones pueden consultarse en la Página Web de la LCG.

C. LA LCG ES UNA COMUNIDAD INTEGRADA A DIFERENTES NIVELES

1. GRUPO CENTRAL DE PROFESORES

Los profesores responsables de las asignaturas del Plan de Estudios se han ido seleccionando con base en tres aspectos fundamentales:

1. su conocimiento del área de estudio
2. su capacidad para estimular la discusión con los estudiantes y destacar los conceptos fundamentales, así como para evaluar su desempeño en función al nivel de maduración en el que se encuentran
3. Su generosidad y entrega hacia los estudiantes

En la actualidad contamos con un grupo de profesores que presentan las características mencionadas. Estos profesores tienen como meta la formación integral de los estudiantes y no escatiman ningún esfuerzo para lograr dicha meta. Sus satisfacciones personales se llenan al ver que los estudiantes progresan en su formación. Esto desemboca en que la relación profesor alumno se convierta en una relación de colegas donde ambas partes establecen un círculo virtuoso de relaciones académicas y humanas.

2. ESTUDIANTES AVANZADOS Y AYUDANTES.

Como se ha destacado en múltiples ocasiones, la LCG pretende integrar en una sola persona, el estudiante, conocimiento y habilidades que se encuentran dispersas en distintos integrantes del cuerpo de profesores y conferencistas. Para lograr la integración entre las diferentes disciplinas un factor fundamental han sido los estudiantes avanzados, que en muchos casos participan como ayudantes de profesor y que proporcionan un engranaje entre las diferentes materias.

Por otra parte, la comunicación continua entre estudiantes de distintas generaciones ha permitido la generación de un ambiente de confianza que estimula la superación personal de cada estudiante así como la superación de la LCG en general.

3. CONFERENCISTAS NACIONALES E INTERNACIONALES.

Los ciclos de seminarios de investigación que conforman las actividades “Fronteras de la Genómica” y “Aplicaciones de la Genómica” requieren del entusiasmo y generosidad de un elevado número de profesores visitantes, tanto del extranjero como nacionales. Estos investigadores han dedicado su tiempo y esfuerzo a discutir con los estudiantes, tanto en seminarios formales como en reuniones informales e incluso sociales. Esto ha permitido la formación de una extensa red de investigadores que ha abierto las puertas de instituciones de muy elevado prestigio tanto a estudiantes como a profesores. Gracias a este esfuerzo los egresados de la LCG se sienten parte de la Comunidad Científica Internacional.

D. FACTORES INDISPENSABLES PARA EL ÉXITO DE UNA LICENCIATURA EN CIENCIAS GENÓMICAS

Hemos presentado a la LCG como un modelo exitoso para la formación inicial de futuros líderes de las Ciencias Genómicas. Es importante reflexionar cuales son los aspectos fundamentales del éxito de esta Licenciatura. Como Coordinador actual estoy convencido de que los siguientes son requisitos indispensables para el éxito de una Licenciatura en Ciencias Genómicas:

1. Contar con un grupo central de profesores con compromiso, entrega y generosidad absoluta hacia los estudiantes
2. Contar con un grupo de estudiantes avanzados y egresados que coadyuven al sistema de enseñanza-aprendizaje
3. Estar inmersa en un Campus Universitario de investigación
4. Contar con un sistema ad hoc para la selección de aspirantes

E. PERSPECTIVAS

Como se ha mencionado, un centenar de egresados de la LCG se encuentran realizando estudios de posgrado. Tengo evidencia de que al principio del año entrante recibirá su grado de Doctora una estudiante de la primera generación. A partir de esta fecha, la obtención de grados se convertirá en un proceso continuo. Para completar su formación académica los futuros investigadores deberán realizar entrenamiento de posgrado con duración promedio de dos años. Esto significa que dentro de tres años tendremos la posibilidad de iniciar la incorporación de investigadores con una formación de excelencia. México tendrá la oportunidad única de convertirse en uno de los países líderes de las Ciencias Genómicas.

Es fundamental que las distintas Instituciones e investigadores interesadas en el desarrollo de las Ciencias Genómicas en México consideren dentro de sus planes futuros la repatriación e incorporación como investigadores de estos nuevos líderes.

En mi calidad de Investigador Emérito del Centro de Ciencias Genómicas estoy decidido a impulsar la incorporación a nuestro país de egresados de la LCG como investigadores.

F. DESIGNACIÓN DEL COORDINADOR DE LA LCG PARA EL PERÍODO 2011-2013

La Legislación Universitaria establece que el Comité Académico deberá proponer al Rector al investigador que considere idóneo para coordinar la LCG para el período correspondiente. Tomando en cuenta la proposición del Comité Académico el Rector nombrará al Coordinador de la LCG. También establece la legislación que un investigador podrá ser nombrado hasta tres veces Coordinador de la LCG, lo cual significaría un total de seis años.

Los cuatro años que he estado al frente de la LCG han requerido de un enorme esfuerzo y dedicación de tiempo por mi parte, sin embargo, las satisfacciones que he tenido al ver crecer a los estudiantes en su carrera académica, han superado con creces el esfuerzo invertido y han colmado mi vida de importantes valores académicos y humanos.

En caso de que el Comité Académico me proponga y el Rector decida nombrarme Coordinador para completar un total de seis años, continuaré sirviendo a la LCG con el mismo entusiasmo y entrega que lo he hecho hasta ahora. Por el contrario, si la designación recae en otro investigador, estoy dispuesto a ayudar en todo aquello que se encuentre dentro de mis posibilidades. Deseo finalmente agradecer a la Comunidad Académica de la LCG, y en particular a los estudiantes, por todas las satisfacciones recibidas.

Dr. Rafael Palacios